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Un grand nombre de méthodes analytiques en analyse classique remplissent ces tâches. Pour les molécules biologiques, elles atteignent cependant leurs limites à cause du poids moléculaire élevé et de la stabilité conditionnée. Les méthodes de la bioanalyse, qui tiennent compte de ces paramètres, ont été développées et améliorées ces dernières décennies, et notamment les méthodes par électrophorèse. L'électrophorèse sur gel en unidimensionnelle ou bi-dimensionnelle, avec ou sans dénaturation (par exemple SDS-PAGE), l'électrophorèse capillaire, la focalisation isoélectrique (FIE) et les techniques de transfert qui y sont liées (par exemple le transfert de protéines) sont devenues des normes.
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