|
Podstatou projektu je studium dynamických aspektů konformace peptidů ve vodném prostředí, jehož vliv na strukturní vlastnosti je z hlediska biologické role nejdůležitější. Abychom získali spolehlivé fyzikální poznatky, navrhujeme směřovat od jednoduchého ke složitějšímu, od jednoduchých modelových dipeptidů ke komplexnějším systémům. Experimentálně je projekt založen na využití Ramanovy optické aktivity (ROA) a Ramanova rozptylu, které umožňují získat informaci o rovnovážné distribuci rychle fluktuujících struktur. Doplňující informace bude získána i z NMR experimentů. Pro interpretaci naměřených dat budou vyvinuty nové nebo adaptovány existující metody zahrnujících jak konformační flexibilitu studovaných systémů tak i vliv rozpouštědla. Pro větší oligopeptidy budou silová pole a tenzory polarizovatelnosti určující jejich spektrální vlastnosti konstruovány pomocí přenosu atomových tenzorů. Hlavním cílem je zaplnit mezeru ve znalostech chování jednoduchých dipeptidů a proteinů, a hlouběji porozumět spektrům těchto systémů.
|