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The principal objective of this study was to establish and compare the analytical sensitivities of three commercial genetic material extraction methods (TRIzol reagent, FTA cards, and QIAGEN kits) along with three selected viruses, adenovirus, hepatitis A virus, and rotavirus.
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Lorsque du matériel génétique de virus responsables d’intoxications alimentaires est extrait, deux grands types d’approches sont offerts : des méthodes conventionnelles déjà bien établies mais habituellement longues et exigeantes à réaliser ou des trousses commerciales plus rapides et faciles d’utilisation mais qui sont beaucoup plus onéreuses. Il est alors important d’évaluer certains paramètres de performance dont la sensibilité analytique afin de choisir la meilleure technique dans chaque situation. Le principal objectif de cette étude était d’établir et de comparer les sensibilités analytiques de trois méthodes d’extraction de matériel génétique (le réactif TRIzol, la matrice FTA et la trousse QIAGEN) sur trois virus choisis, l’adénovirus, le virus de l’hépatite A et le rotavirus. La détection virale a été réalisée par une technique de PCR standard pour l’adénovirus et par transcription inverse suivie d’une PCR pour le rotavirus et le virus de l’hépatite A. Les résultats obtenus montrent qu’avec la trousse QIAGEN, la sensibilité est meilleure d’un facteur de 2 log par rapport aux deux autres méthodes et ce, pour les trois virus étudiés. Cependant, malgré leurs sensibilités analytiques plus faibles, ces deux autres méthodes d’extraction ne doivent pas être mises de côté et devraient être considérées lors d’évaluation d’approches efficaces et plus appropriées pour des raisons de commodité spécifiques puisque les éclosions d’intoxications alimentaires peuvent être reliées à une grande variété de types d’aliments.
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